高通量測序技術(shù)的快速發(fā)展使得目前對環(huán)境微生物的研究擺脫了對于微生物培養(yǎng)技術(shù)的依賴，但目前國內(nèi)并沒有相對應(yīng)的檢測標(biāo)準(zhǔn)出臺，復(fù)雜的環(huán)境微生物群落，不規(guī)范的檢測方法，也造成了檢測數(shù)據(jù)的混亂及結(jié)論、結(jié)果的矛盾。為了確保高通量測序技術(shù)的有序應(yīng)用，深圳華大基因科技有限公司、深圳基因產(chǎn)學(xué)研資聯(lián)盟、中國測試技術(shù)研究院、深圳華大臨床檢驗中心在國家標(biāo)準(zhǔn)化管理委員會的主管下，起草編制了《環(huán)境微生物宏基因組檢測 高通量測序法》。

 

　　經(jīng)過技術(shù)調(diào)研、咨詢、收集和消化有關(guān)資料，結(jié)合環(huán)境微生物宏基因組檢測方法及高通量測序技術(shù)的應(yīng)用，編制組遵循統(tǒng)一性、協(xié)調(diào)性、適用性、一致性、規(guī)范性的原則，本著先進(jìn)性、科學(xué)性、合理性和可操作性的原則，依據(jù)GB/T 1.1-2009《標(biāo)準(zhǔn)化工作導(dǎo)則 第1部分：標(biāo)準(zhǔn)的結(jié)構(gòu)和編寫》給出的規(guī)則并參照了GB/T 20001.4—2015《標(biāo)準(zhǔn)編寫規(guī)則 第4部分：實驗方法標(biāo)準(zhǔn)》，在引用了GB/T 6682《分析試驗室用水規(guī)格和實驗方法》、GB 19489-2008《實驗室生物安全通用要求》、GB/T 19495.5-2004《轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品檢測核酸定量 PCR檢測方法》、GB/T 30989-2014《高通量基因測序技術(shù)規(guī)程》、GB/T 35537-2017《高通量基因測序結(jié)果評價要求》等文件后，規(guī)定了基于高通量測序進(jìn)行環(huán)境微生物宏基因組檢測的主要內(nèi)容，包括樣品采集、保存和運(yùn)輸，實驗室樣品接收與處理，微生物DNA樣品的制備，提取后DNA樣品判斷質(zhì)量，后續(xù)文庫構(gòu)建與高通量測序，數(shù)據(jù)質(zhì)控要求，數(shù)據(jù)處理過程，結(jié)果與報告。

 

　　閱讀征求意見稿后可知，標(biāo)準(zhǔn)中所規(guī)定的檢測存在于環(huán)境樣本中微生物的方法原理是，先運(yùn)用高通量測序技術(shù)對環(huán)境樣品中微生物的總體遺傳物質(zhì)進(jìn)行測序,然后通過測序結(jié)果與現(xiàn)有數(shù)據(jù)庫中序列的比對來檢測樣品中所含的微生物的種類和相對豐度。而該方法需要高通量測序儀、PCR儀、冷凍離心機(jī)、微量移液器、紫外分光光度計、電泳儀、凝膠成像系統(tǒng)、水浴鍋、低溫冰箱等設(shè)備。

 

　　相信本標(biāo)準(zhǔn)的建立和普及不僅能夠規(guī)范和統(tǒng)一高通量測序的環(huán)境微生物檢測技術(shù)流程，還能讓健康、環(huán)境、農(nóng)業(yè)等涉及微生物檢測的各個行業(yè)有更統(tǒng)一和順暢的評估、交流語境，從而能為全民健康及工農(nóng)業(yè)技術(shù)進(jìn)步提供有力的保障和支持并促進(jìn)科研及相關(guān)領(lǐng)域經(jīng)濟(jì)的發(fā)展。