布魯克:NMR、MS和SPR在蛋白質(zhì)-配體分析中的應用
表面等離子體共振(SPR)分析是一種光學檢測方法,用于研究配體結(jié)合與膜蛋白的相互作用,這是藥物研究與開發(fā)的主要目標。在進行生物分子相互作用的親和力與動力學測量時,該技術(shù)能提供顯著的益處。由于SPR只能進行結(jié)合過程的分析,已經(jīng)開發(fā)了將SPR與質(zhì)譜(MS)和核磁共振(NMR)波譜相結(jié)合的技術(shù),從而也可以對結(jié)合分子進行檢測。
在日本的埼玉大學,Deepti Diwan和來自材料科學研究所的同事利用核磁共振(NMR)、MS和SPR來研究多價結(jié)合對蛋白質(zhì)-糖類相互作用特異性的影響。研究中使用了Bruker提供的幾種儀器,包括AV400 + Cryo波譜儀、AVANCE 500波譜儀和Autoflex III波譜儀。后者可進行基質(zhì)輔助激光解吸/電離飛行時間質(zhì)譜(MALDI-TOF-MS)分析,當目標生物分子易碎且易于用替代電離技術(shù)裂解時使用。
蛋白質(zhì)-糖相互作用使得在重要的生理過程(如受精、發(fā)育和免疫應答)中發(fā)生重要的細胞間識別事件。這種反應通常是很弱的,但會被所謂的“糖簇效應”放大,聚糖類的多價效應是由于沿著聚合物骨架密集堆積的糖類引起的。
除了增強蛋白質(zhì)-糖相互作用的親和力外,多價性還會引起凝集等其它現(xiàn)象。因此,具有顯著多價性的合成糖共聚物作為生物醫(yī)學應用中的潛在工具變得頗具吸引力。
據(jù)《分子》雜志報道,Diwan及其團隊合成了甘露糖苷作為一種新型糖基化單體,使用自由基聚合制備了它的聚合物、化合物8a和8b。對于聚合反應,使用H-NMR波譜來估測產(chǎn)物的聚合度以確定共聚物成分。NMR波譜分析也被用來確定合成糖基單體以及糖基共聚物的化學結(jié)構(gòu)。
通過利用SPR檢測獲得實時結(jié)合波譜,研究小組研究了合成糖基共聚物與甘露糖/葡萄糖結(jié)合蛋白、刀豆球蛋白A(Con A)之間的相互作用。為了測試Con A-糖基共聚物的相互作用,將凝集素固定在羧甲基葡聚糖包覆(CM5)傳感器芯片的傳感器表面上,并使用聚合物8a和8b作為分析物。
結(jié)果表明,隨著糖基共聚物濃度的增加,Con A的螯合作用增強。所合成聚合物的動力學親和力對凝集素顯示出強烈的、特異性分子識別能力。
進一步的分析表明,由于其結(jié)合化學計量學、結(jié)合率、效價以及Con A簇的穩(wěn)定性,甘露糖殘基成為增強多種相互作用的主要因素。
研究人員寫道,“我們預期,這種合成支架將提供新的手段,以確定多價配體的結(jié)構(gòu),以及凝集素-聚糖相互作用中特定功能的結(jié)合表位密度。”
(責任編輯:金利儀器lyh)